تشمل الأبحاث المستقبلية في علم الأجنة:
1- تطوير تقنيات جديدة لتحليل الجينات الجنينية والتكنولوجيا الجديدة التي تساعد على تشخيص الأمراض الجنينية قبل الولادة.
2- دراسة التفاعلات الجينية التي تؤدي إلى تطور الجنين، والتي يمكن أن تؤثر في ظهور الأمراض الجينية.
3- تحليل التفاعلات بين العوامل الخارجية والجينات الجنينية، مثل التعرض للملوثات البيئية والتغذية الأمومية، ومدى تأثيرها على صحة الجنين وتطوره.
4- استخدام تقنيات الهندسة الوراثية لعلاج الأمراض الجينية، وهذا يشمل النظر في إمكانية علاج أمراض مثل التلاسيميا والوحدة اللاطفيلية.
5- استخدام الإنسان “الجامود” أو “الكائن الحي الاصطناعي” في الأبحاث على الجنين والتطور الجنيني، والتي يمكن أن تساعد في فهم كيفية تطور الأحياء من الخلية الواحدة إلى كائن حي كامل.