تختلف الأدوات المستخدمة في البحث العلمي في الهندسة الصناعية بناءً على موضوع البحث والمنهجية المستخدمة، ولكن إليك بعض الأدوات الشائعة:
1- الحوسبة العلمية والنمذجة الرياضية.
2- تقنيات نظم المعلومات الجغرافية GIS.
3- تحليل الشبكات والعلاقات الرياضية.
4- تقنيات التحليل الإحصائي والاحتمالات.
5- تقنيات تصميم التجارب والاختبارات.
6- تحليل البيانات المختلفة وتقنيات التنبؤ.
7- تطبيقات الذكاء الاصطناعي وتعلم الآلة.
8- تقنيات توازن الخطوط الإنتاجية.
9- تحليل الأعمال والنماذج المالية.
10- تصميم وتحليل وتحسين عمليات الإنتاج والتصنيع.