الإشعاع الكوني يؤثر على الأجرام في الميكانيك السماوية بعدة طرق. فمن بين هذه الأثر:
1- إنتاج الكهرومغناطيسية: يعمل الإشعاع الكوني على إنتاج التشويهات المغناطيسية في مواد الأجسام السماوية الحاملة للحقول المغناطيسية. وتؤدي هذه التشويهات إلى توليد تيارات كهربائية داخل الجسم السماوي.
2- تطفو البراكين في الطبقة الجوية العليا: يعمل الإشعاع الكوني على تنشيط المزيد من الجزيئات تحت شكل العديد من الكونترات الهوائية، مما يؤدي إلى تكون مزيد من العادم البركاني، ويؤثر هذا الإرتفاع في الأنماط الجوية وأيضًا على المناخ.
3- الأشعة الكونية: تعني هذه الأشعة تلك الجزيئات التي تشكلت بفعل النشاطات في الكواكب الغير عصوية وتنعكس بتلك التي تكونت بشكل طبيعي في الأجرام السماوية الأخرى، وتعمل هذه الأشعة على توليد التقنية الطاقة، وأيضًا على تحديد بعض الخصائص الكيميائية للأجرام السماوية. وبالتالي، يوفر الإشعاع الكوني إمكانية تحديد تركيب العديد من الأجرام في المجموعة الشمسية والكواكب الأخرى.