هناك عدة آليات يتم استخدامها في التدقيق في نظم الإدارة الإلكترونية، ومن بينها:
1- التدقيق الداخلي: ويشمل هذا النوع من التدقيق على عمليات التحقق والرصد المستمر لتأكد من تطبيق السياسات والإجراءات والمعايير المتفق عليها في النظام.
2- التدقيق الخارجي: وهو عملية التحقق التي يتم تنفيذها بواسطة جهات خارجية مهنية ومتخصصة لتوفير تقارير وتوصيات تزيد من كفاءة النظام.
3- التدقيق الإداري: وهو النوع الذي يتم في إطار إجراءات الإدارة اليومية، ويشمل تحليل السياسات والإجراءات والإشراف على الأنشطة والعمليات.
4- التدقيق المالي: يركز هذا النوع من التدقيق على الجوانب المالية للنظام ويتضمن التحقق من صحة الحسابات المالية والقوائم المالية والتقارير المالية الأخرى.
5- التدقيق العملياتي: ويتمثل هذا النوع من التدقيق في تحليل العمليات اليومية للنظام ومراجعة الإجراءات الداخلية لضمان الامتثال للقوانين واللوائح وتحقيق الكفاءة في الأداء.
6- التدقيق القانوني: ويشمل هذا النوع من التدقيق تحديد مدى مطابقة النظام للقوانين واللوائح واللوائح الخاصة بالجهات الحكومية والمنظمات الأخرى.