يعمل المهندس الطبي في إدارة المستشفيات على تزويد الخدمات الصحية بالتقنيات والأجهزة الحديثة التي تساعد في تشخيص وعلاج المرضى، كما يقوم بتطوير وتحسين العمليات الإدارية والتشغيلية في المستشفى.
يتولى المهندس الطبي أيضاً مسؤولية تصميم وتخطيط الأقسام والمرافق الطبية، وإدارة وصيانة الأجهزة الطبية والمعدات الطبية الحيوية. وتشمل مهامه أيضًا التدريب والتوعية للعاملين بالمستشفى وتعزيز التواصل بين الأطقم الطبية المختلفة.
بالإضافة إلى ذلك، فإن المهندس الطبي يتابع الابتكارات الطبية الحديثة وتطوراتها ويطلع على أحدث الأبحاث الطبية لتطبيقها على المستوى المحلي، ويعمل على ضمان تطبيق المعايير الصحية والأمنية والتقنية في المستشفى.