تلعب الأحياء البحرية العميقة دورًا حيويًا في البيئة البحرية، حيث تسهم في:
1- دوران المواد العضوية في البحار.
2- إنتاج الطاقة من خلال الأيض الجيد وترسيب الكربون في القاع البحري.
3- الحفاظ على التنوع الحيوي في المحيطات.
4- تأثيرها على النظام الأحيائي للبحر، فمثلاً بعض أنواع الأحياء البحرية العميقة تشكل روابط غذائية حيوية لأنواع أخرى من الحيوانات البحرية.
5- أيضاً الأحياء البحرية العميقة توفر مصادر مواد حيوية وأدوية جداً مهمة كما أنها تقدم إمكانيات جديدة للاستفادة منها في مجالات تقنية الحياة الحديثة.