يستخدم القرآن الكريم نفسه كمصدر أساسي للتفسير، حيث يستشهد التفسير القرآني بآيات القرآن الأخرى لشرح معانيها، وذلك من خلال عملية مقارنة الآيات المختلفة ودراسة السياق القرآني والتاريخي واللغوي لها.
ويستخدم التفسير القرآني أيضاً السنة النبوية والأحاديث النبوية في التفسير والتوضيح للآيات القرآنية، حيث يتم تفسير أحداث السنة وكيفية تعامل الرسول صلى الله عليه وسلم مع مسائل معينة في القرآن.
وعلاوة على ذلك، يستخدم التفسير القرآني أيضاً العرف والتاريخ واللغة العربية والتفسيرات السابقة والتأويلات الفلسفية والتراثية لتفسير معاني الآيات القرآنية بشكل دقيق.
ولكن يجب الانتباه إلى أن تفسير القرآن ليس بالأمر السهل، ويحتاج إلى دراسة وتحليل ورصد لسياق الآيات والأحداث التاريخية واللغوية والاجتماعية المرتبطة بها، ولذلك يعتمد تفسير القرآن على صلاحيات العلماء والمفسرين المتخصصين في هذا المجال.