تعتمد طريقة جمع العينات الطبية على نوع العينة المطلوبة والفحص الذي سيتم إجراؤه. ومن ضمن الطرق الشائعة لجمع العينات الطبية :
1- جمع عينة الدم: عن طريق إدخال إبرة في وريد المريض لسحب عينة دم.
2- جمع عينة البول: عن طريق توجيه البول لتحليله، سواءً من خلال التبوّل في عينة مخصصة لذلك أو عبر إدراج قطعة صغيرة من القطن في المهبل او الشرج لجمع البول.
3- جمع عينة البراز: تجميع بعض الأحيان بدون إضافة أي شيء، أما في بعض الحالات الأخرى قد يتم استخدام محلول لتسهيل الجمع، ويتم جمع البراز في حاوية نظيفة ومخصصة لذلك.
4- جمع العينة البكتيرية او فحص المخاط: يتم جمع العينة من أحد مناطق الجسم التي تحتوي على المخاط مثل الأنف أو الحلق verbal الخ. ويتم جمع العينة باستخدام قطعة شاش ، قطعة قطن أو أداة خاصة.
5- جمع عينة الأنسجة: تتم جراحة صغيرة على الجسم لجمع عينة من الأنسجة التي يتم الفحص عليها.