يتكامل نظام المعلومات الإدارية مع العمليات التجارية الأخرى بالطرق التالية:
1- التكامل مع نظام إدارة العلاقات مع العملاء (CRM): يمكن لنظام المعلومات الإدارية تحديث قاعدة البيانات المرتبطة بنظام إدارة العلاقات مع العملاء بشأن المبيعات وخدمات العملاء وغيرها، وهذا يعطي إدارة العملاء دقة وفعالية في المبيعات الجارية والتخطيط لتحسين العوائد.
2- التكامل مع نظام إدارة سلسلة التوريد (SCM): يساعد نظام المعلومات الإدارية في إدارة سلسلة التوريد، وذلك من خلال الرصد الإحصائي للمخزون، وطلبات التوريدات الجديدة، والعمليات اللوجستية وهذا يعطي شركة الفرصة للحد من العمليات المتكررة وسحب المرتجعات وتحسين فترة التوريد.
3- التكامل مع نظام إدارة الموارد البشرية (HRM): يساعد النظام في إدارة العاملين الموجودين باستخدام معلومات مثل الرواتب، الحضور والانصراف، ومستوى الأداء والتدريب وتحليل البيانات المرتبطة بهم. وذلك يوفر المزيد من التناسق بين مختلف الإدارات في الشركة.
4- التكامل مع نظام إدارة المشاريع (PM): يسمح نظام المعلومات الإدارية لمشروع بالتحكم في موارد العمل الخاصة به من خلال إدارة مختلف مشروعاته الفرعية، ومراقبة تقدمعمليات التصميم، وتوزيع الموظّفين، وإدخال التطبيقات التقنية في الحلقة. وبذلك تتحقق الإدارة على مستوى الشركة كلها، وتخفض التكاليف.