في عام 1999، قدمت شركة بيجو تحديثًا لنصف عمر الطراز لمجموعة 406، وجنبًا إلى جنب مع السيدان والكوبيه، تم ترقية إصدار واجون الخاص بالشركة أيضًا. حققت بيجو نجاحًا هائلًا مع تشكيلة 406، وبفضل خبرتها الواسعة في إنتاج سيارات الواجون، قدمت نوعًا مماثلاً لهذا الهيكل لمنافسها في فئة الحجم المتوسط. ومع مرور بضع سنوات على السوق، بدت السيارة بالفعل قديمة، واضطرت بيجو لمواجهة موجة جديدة من اتجاه التصميم البيولوجي الذي دفع بسيارة “مونديو” إلى الصدارة في قوائم المبيعات.
من الأمام، قامت الشركة الفرنسية بالتخلي عن الشبكة المعترقة من طراز 1996 واستبدلتها بشبكة سوداء مشدودة. تلقت المصابيح الأمامية زاوية جديدة في الجزء العلوي لها وأصبحت أكثر عدوانية. قصرت بيجو الشبكة الابتسامة في المصد الأمامي، وشكلتها من جديد، وأضافت زوجًا من مصابيح الضباب: لا مزيد من الوجوه المبتسمة في مجموعة 406 من الآن فصاعداً. في الجزء الخلفي، لم يفكر الشركة في إجراء أي تغييرات.
في الداخل، حدثت مزيد من التغييرات على لوحة القيادة. قامت الشركة بتركيب لوحة عدادات جديدة بعدما قامت بتوسيع القوانين ووضعت حلقات كروم حولها. على الركيزة المركزية المعاد تصميمها، ظهرت تحكمات جديدة لنظام التدفئة وتكييف الهواء ونظام صوت جديد أيضًا. في الجزء الخلفي، كان لدى واجون 406 مساحة كافية لثلاثة ركاب وصندوق كبير يبلغ حجمه 526 لترًا (18.6 قدم مكعب) مع جميع المقاعد في وضعها وحتى 1,741 لترًا (61.5 قدم مكعب) مع طي المقعد الخلفي.
قدمت الشركة مجموعة واسعة من المحركات تتراوح بين 90 حصانًا و210 حصانًا تحت غطاء المحرك. كمفاجأة لطراز 1999، قدمت الشركة محركات HDI الجديدة بسعة 2.0 لتر متوفرة بقوة 90 و110 و136 حصانًا على التوالي.
أما بالنسبة لمواصفات المحرك، فقد تمثلت في محرك سعة 1.8 لتر 16 صمامًا بناقل حركة أوتوماتيكي من 4 سرعات، يولد قوة 112 حصانًا عند 5500 دورة في الدقيقة، وعزم دوران يصل إلى 114 رطل-قدم عند 4250 دورة في الدقيقة. تعمل بنظام حقن متعدد النقاط بالوقود البنزين. تأتي بنظام دفع أمامي، وتحمل أقراص مكابح مهواة في الأمام وأسطوانات في الخلف. تعتمد على إطارات بحجم 195/65HR15.
أبعاد السيارة تقدر بطول 186.6 إنش (4740 ملم)، وعرض 69.3 إنش (1760 ملم)، وارتفاع 57.5 إنش (1461 ملم)، مع قاعدة عجلات تصل إلى 106.3 إنش (2700 ملم). يبلغ حجم الشحن 18.6 قدم مكعب (527 لتر)، ويبلغ وزنها الخالي من الحمولة 2877 رطل (1305 كجم).
فيما يتعلق بأدائها، تصل سرعتها القصوى إلى 114 ميلا في الساعة (183 كم/ساعة)، وتستغرق 15.4 ثانية للتسارع من 0 إلى 62 ميلا في الساعة (0 إلى 100 كم/ساعة). كما تتميز بمستوى استهلاك وقود معتدل يبلغ 26.1 ميلا في الغالون الأمريكي (9 لتر/100 كم) في الاستخدام المختلط.
تتميز بمقاييس بيئية جيدة حيث تصدر 224 جرام/كم من انبعاثات ثاني أكسيد الكربون. كما تحمل اسم 406 Break، وتشمل فترة الإنتاج سنوات 1996 إلى 2004. تتبع الطرازات التي تم إنتاجها تحت علامة بيجو.